تیم

۱- عضو هیئت علمی دانشگاه غیر انتفاعی دانش البرز از سال ۱۳۹۷ تاکنون
۲- مدرس دانشگاه غیر انتفاعی علم و فرهنگ و پژوهشگاه رویان در مقاطع تحصیلات تکمیلی (ارشد و دکتری) از سال ۱۳۹۹ تاکنون
۳- مدرس دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران مرکز در دو مقطع کارشناسی و کارشناسی ارشد از سال ۱۴۰۳ تاکنون
۴- مدرس دانشگاه پیام نور تالش در سالهای ۹۶ – ۹۲ (شامل دروس کارشناسی زیست شناسی و آزمایشگاههای مربوطه)
۵- کارشناس آزمایشگاه جنین شناسی دانشگاه کردستان در نیمسال دوم ۸۹-۸۸ و نیمسال اول ۹۰-۸۹
۶- مدرس کارگاههای آموزشی بیوانفورماتیک، طراحی پرایمر با نرم افزارهای کاربردی، PCR Troubleshooting، مبانی کاربردی بیوانفورماتیک

۱- کارشناس آزمایشگاه جنین شناسی دانشگاه کردستان در نیمسال دوم ۸۹-۸۸ و نیمسال اول ۹۰-۸۹
۲- مدرس دانشگاه پیام نور تالش در سالهای ۹۶ – ۹۲ (شامل دروس کارشناسی زیست شناسی و آزمایشگاه¬های مربوطه)
۳- مسئول آزمایشگاه ژنتیک پیشگام به مدت یکسال از اردیبهشت سال ۹۸-۹۷ تا اردیبهشت سال ۹۹-۹۸
۴-عضو هیئت علمی دانشگاه غیر انتفاعی دانش البرز از سال ۱۳۹۷ تاکنون (شامل دروس کارشناسی و کارشناسی ارشد زیست شناسی و ژنتیک و بیوتکنولوژی و آزمایشگاه¬های مربوطه)
۵- مدرس دانشگاه غیر انتفاعی علم و فرهنگ و پژوهشگاه رویان در مقاطع تحصیلات تکمیلی (ارشد و دکتری) از سال ۱۳۹۹ تاکنون
۶- مدرس دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران مرکز در دو مقطع کارشناسی و کارشناسی ارشد از سال ۱۴۰۳ تاکنون
۷- عضو شورای فرهنگی دانشگاه دانش البرز از سال ۱۴۰۲ تاکنون
۸- استاد مشاور گاهنامه علمی جینیس دانشگاه دانش البرز
۹- داور مجلات معتبر علمی از جمله مجلات “Iranian Journal of Public Heath” ، مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی، مجله پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تبریز و …
۱۰- مدرس کارگاه¬های آموزشی بیوانفورماتیک، طراحی پرایمر با نرم افزارهای کاربردی، PCR Troubleshooting، مبانی کاربردی بیوانفورماتیک
۱۱- مدرس کارگاه مهندسی ژنتیک و سخنران پانزدهمین مدرسه تابستانی رویان در مرداد ماه سال ۱۴۰۳.
۱۲- مسئول پنل کاربرد علم داده در علوم زیستی در سمینار علم داده ها و کاربردهای آن در ارتقای کیفیت و بهره وری صنایع در دانشگاه های علامه طبابایی، دانشگاه غیات الدین جمشید کاشانی، دانشگاه دانش البرز در پاییز ۱۴۰۲.

۶-۱ تالیف کتاب «سیتوژنتیک» مقطع دکتری ژنتیک مولکولی برای موسسه مدرسان شریف
۶-۲ تالیف کتاب «روش¬های نوین مهندسی ژنتیک» با همکاری گروهی از دانشجویان دکتری ژنتیک مولکولی ورودی ۹۲ پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فن آوری تحت نظارت دکتر علوی از پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فن آوری
۶-۳ ترجمه کتاب «ژنتیک پزشکی تامسون» تحت نظارت دکتر نجات مهدیه از دانشگاه علوم پزشکی ایران
۶-۴ ترجمه کتاب «ژنتیک رفتاری» تحت نظارت دکتر خرمدل از دانشگاه شیراز
۶-۵ ترجمه کتاب «سلولی مولکولی لودیش» تحت نظارت دکتر نجات مهدیه از دانشگاه علوم پزشکی ایران

۱- Association of Two Polymorphic Codons in P53 and ABCC1 Promoter with Prostate Cancer, Iranian Journal of Biotechnology, 2015.
Farinaz Behfarjam, Jalal Rostamzadeh, Mohammad Ali Zarei, Bahram Nikkhoo
—-
۲-معرفی فن آوری نوین توالی یابی، مجله ایمنی زیستی، ۱۳۹۵
فریناز به فرجام، وحید شریعتی، امیر موسوی
—–
۳ – Role of Th1/Th2 cells and related cytokines in autoimmune hepatitis, The Turkish journal of Gastroenterology, 2016.
Behfarjam F, Sanati MH, Nasseri Moghaddam S, Ataei M, Nikfam S, Jadali Z
—-
۴ – Vitiligo patients show significant up-regulation of aryl hydrocarbon receptor transcription factor, An Bras Dermatol, 2018.
Behfarjam F, Jadali Z
—-
۵ – Imbalance of peripheral blood T helper type 17 responses in patients with vitiligo, Iran J Allergy Asthma Immunol, 2018.
Behfarjam F, Mansoori P, Jadali Z
—–
۶ – IFN-γ siRNA effectively knocked down IFN-γ gene expression and reduced cytokine secretion in PBMCs of patients with AIH, Hepatitis monthly, 2018.
Behfarjam F, Sanati MH, Jadali Z, Soheili ZS, Nasseri Moghaddam S, Ataei M, Nikfam S
—-
۷ – Increased Expression of Aryl Hydrocarbon Receptor in Peripheral Blood Mononuclear Cells of Patients with Autoimmune Hepatitis, Middle East Journal of Digestive Diseases, 2018.
Behfarjam F, Jadali Z
—–
۸- Enhanced Th17 responses in patients with autoimmune hepatitis, Middle East Journal of Digestive Diseases, 2018.
Behfarjam F, Nasseri Moghaddam S, Jadali Z
—–
۹- TIM-3 genetic variants and risk of Behcet disease in the Iranian population, An bras dermatol ,2018.
Ataei M, Behfarjam F, Jadali Z
—–
۱۰- Identification of key genes as potential biomarkers involved in triple-negative breast cancer using RNA sequencing transcriptomic data analysis of breast cancer patients compared to healthy individuals, cellular and molecular research, 2023.
Pegah Mahboobnia, Mostafa Rafiepour, Reza Mahdian, Farinaz Behfarjam

تعدادی از پایان نامه های ذیل در مراکز مربوطه به صرت طرح های پژوهشی ارائه و انجام شده است.

۱- بررسی الگوهای بیان ژن و مکانیسم های مولکولی درگیر در بیماری دیابت نوع دو با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی – دانشگاه دانش البرز
۲- بررسی مکانیسم های مولکولی و شبکه های ژنی دخیل در سرطان تخمدان با استفاده از آنالیز داده های ترانس¬کریپتوم– دانشگاه دانش البرز
۳- بررسی تاثیر مصرف مکمل رزوراترول بر آنزیم های کاتالاز، گلوتاتیون پراکسیداز، گلوتاتیون احیا شده و بیان ژن TNF-α در بافت کلیه موش های مبتلا به دیابت– دانشگاه دانش البرز مشترک با شرکت داروسازی
۴- شناسایی ژن¬های کلیدی و مسیر¬های سیگنالی مرتبط با پیشرفت سرطان معده با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی– دانشگاه دانش البرز
۵- تجزیه و تحلیل پروفایل ژنومی بیماران مبتلا به سرطان تخمدان با هدف شناسایی واریانت های ژنتیکی – دانشگاه دانش البرز
۶- شناسایی واریانت های ژنتیکی دخیل در سرطان پستان با استفاده از تکنیک RNA seq– دانشگاه دانش البرز
۷- بررسی نقش miRNAها در افراد مبتلا به سرطان پستان به کمک آنالیز¬های بیوانفورماتیکی– دانشگاه دانش البرز
۸- تاثیر پلی مورفیسم¬های ناحیه پروموتوری SIRT1 در افراد مبتلا به دیابت نوع دو– دانشگاه دانش البرز مشترک با آزمایشگاه هشتگرد
۹- شناسایی بیوانفورماتیکی عملکرد miRNA های مرتبط با دیابت نوع دو– دانشگاه دانش البرز
۱۰- مطالعه رابطه بین میکروبیوتای روده و متابولومیک در سرطان کبد با استفاده از تجزیه و تحلیل داده های متااُمیکس– دانشگاه دانش البرز
۱۱- شناسایی واریانت های ژنتیکی دخیل در بیماری دیابت نوع ۲ با استفاده از داده های ترانسکریپتوم– دانشگاه دانش البرز
۱۲- آنالیز بیوانفورماتیکی داده های ترانسکریپتوم بیماران مبتلا به دیابت نوع دو با هدف شناسایی LncRNA¬¬های دخیل در بیماریزایی– دانشگاه دانش البرز
۱۳- شناسایی و مقایسه واریانت های ژنتیکی گونه های جنس باسیلوس به عنوان پاتوژن غذایی با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی– دانشگاه دانش البرز
۱۴- شناسایی و مقایسه واریانت های ژنتیکی دخیل در تنوع فنوتیپی افراد مبتلا به دو نوع تالاسمی بتا (Major – Intermedia) با استفاده از آنالیز داده‌های ترانسکریپتوم- دانشگاه دانش البرز
۱۵- بررسی شکست DNA اسپرم در افراد الیگوآستنواسپرمی و تاثیر آن بر عمل ICSI و تشکیل جنین در مرکز ناباروری رویش کرج – دانشگاه دانش البرز مشترک با مرکز ناباروی رویش کرج
۱۶- شناسایی ژن های با اختلاف بیان معنی دار در نمونه های بیماران مبتلا به سرطان سینه با استفاده از داده های ترانسکریپتوم– دانشگاه دانش البرز
۱۷- بررسی نقش lncRNA ها در بیماران مبتلا به سرطان پستان با استفاده از داده های ترانسکریپتوم– دانشگاه دانش البرز
۱۸- تجزیه و تحلیل کل رونوشت ژنوم انسان به منظور شناسایی و بررسی نقش RNA های تنظیمی (lncRNAs و miRNAs) مرتبط با تالاسمی بتا با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی– دانشگاه دانش البرز
۱۹- شناسایی RNA های طولانی غیر کد کننده (LncRNAs) مرتبط با شدت فنوتیپی در حالت های مختلف (RRMS, PPMS, SPMS) بیماری مولتیپل اسکلروزیس– دانشگاه دانش البرز
۲۰- بررسی فراوانی جهش های موجود در منطقه D-loop و مناطق مجاور از ژنوم میتوکندری در بیماران مبتلا به دیابت در مقایسه با افراد سالم– دانشگاه دانش البرز مشترک با دانشگاه علوم پزشکی البرز
۲۱- بررسی نقش فاکتورهای ژنتیکی Annexin و TLR4 و پلی مورفیسم ژنtlr4 در بیماران مبتلا به دیابت نوع دو– دانشگاه دانش البرز مشترک با آزمایشگاه هشتگرد
۲۲- بررسی نقش RNA های غیر کد کننده (LncRNAs & microRNAs) در پاتوژنز و جنبه های درمانی آندومتریوز– دانشگاه دانش البرز
۲۳- تحلیل پروفایل‌های بیان ژن و مکانیسم‌های مولکولی مرتبط با استئوسارکوم با استفاده از داده‌های ترنسکریپتوم– دانشگاه دانش البرز
۲۴- مقایسه پروفایل بیان ژن بیماران مبتلا به سرطان پستان با رنج سنی متفاوت با هدف بررسی تأثیر سن بر ایجاد بیماری– دانشگاه دانش البرز
۲۵- مطالعه ارتباط واریانت های rs4527238 و rs7482144 در ژن های ANTXR1 و HBG2با سطح HbF در افراد بتا تالاسمی مینور ناقل جهش IVS-II-1 (G>A)– دانشگاه دانش البرز مشترک با انستیتو پاستور
۲۶- بررسی الگوی بیان ژن و مکانیسم¬های مولکولی دخیل در بیماران مبتلا به سندروم تخمدان پلی کیستیک (PCOS) با استفاده از داده¬های ترانسکریپتوم – دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران مرکز
۲۷- مطالعه نقش MicroRNAs و CircRNAs به عنوان سطح جدیدی از مکانیسم تنظیمی مولکول¬های کوچک غیررمزگردان بر بیماریزایی مالتیپل اسکلروزیس نوع عود کننده-فروکش کننده– دانشگاه دانش البرز
۲۸- مقایسه بیان ژن¬های کلیدی PTEN/Smad4و HER3 و بررسی نقش Mir-205 در بیماران مبتلا به سرطان پستان– دانشگاه دانش البرز مشترک با انستیتو پاستور
۲۹- بررسی تغییرات mir490 و ارتباط آن با ژن FOX1 در بیماران ایرانی مبتلا به سرطان کولورکتال– دانشگاه دانش البرز مشترک با پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک
۳۰- شناسایی ژن¬های هاب و مسیرهای کلیدی مرتبط با مالتیپل اسکلروزیس بر اساس تجزیه و تحلیل شبکه ژنی– دانشگاه دانش البرز
۳۱- بررسی پروفایل بیانی ¬CircRNA ¬¬ها در افراد مبتلا به سرطان تخمدان با آنالیز داده های ترانسکریپتوم– دانشگاه دانش البرز
۳۲- شناسایی Long non-coding RNAs و ژن¬های دارای بیان افتراقی و بررسی ارتباط احتمالی آن¬ها در بافت چربی افراد مبتلا به سندرم تخمدان پلی کیستیک با استفاده از آنالیز داده¬های ترنسکریپتوم-پژوهشگاه رویان
۳۳- تجزیه و تحلیل جامع پروفایل¬های بیان ژن جهت شناسایی عوامل پیش آگهی در سرطان پستان اولیه و متاستاتیک-پژوهشگاه رویان
۳۴- غربالگری و مقایسه واریانت‌های مرتبط با بیومارکرهای مهم در سرطان سینه اولیه و متاستاتیک-پژوهشگاه رویان

دستاوردها:
۱- جزو۵ نفر برتر در مقطع کارشناسی
۲- کسب رتبه اول در مقطع کارشناسی ارشد و عضویت در انجمن استعدادهای درخشان
۳- کسب رتبه اول در مقطع دکتری
۴- پژوهشگر برگزیده دانشگاه دانش البرز در سال ۱۴۰۳

---

کارگاه های آموزشی:
۱ – “کارگاه آشنایی با نرم افزار SPSS” برگزار شده در دانشگاه کردستان گروه علوم زیستی و بیوتکنولوژی
۲ – “کارگاه آشنایی با نرم افزار Endnote” برگزار شده در دانشگاه کردستان گروه علوم زیستی و بیوتکنولوژی
۳ – “کارگاه آشنایی و کار با حیوانات آزمایشگاهی” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۴ – “کارگاه بیوانفورماتیک” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۵ – “کارگاه پروتئومیکس و کاربرد¬های آن در علوم انسانی” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۶ – “کارگاه اصول مهندسی ژنتیک و کلونینگ” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۷ – “کارگاه پیشگویی ساختار سه بعدی پروتئین” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۸ – “کارگاه آشنایی با نرم افزار پروژنی ۷” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۹ – کارگاه تئوری و عملی “اصول استفاده از روش HRM در مطالعات ژنتیک و اپی ژنتیک” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۱۰ – “کارگاه HPLC, TLC, CE, CD spectropolarimetry, LC-MS, GC-MS and Mass Spectroscopy” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۱۱ – “کارگاه آشنایی با نرم افزار SPSS” برگزار شده در پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فن آوری
۱۲ – “کارگاه آشنایی با نرم افزار Geneious” برگزار شده در پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فن آوری
۱۳ – “کارگاه Real Time PCR” برگزار شده در دانشگاه تربیت مدرس از طرف شرکت Ampliqon A/S
۱۴ – “کارگاه طراحی آر ان ای مداخله گر دقیق و عملکردی” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۱۵ – “کارگاه Real Time PCR” برگزار شده در پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فن آوری از طرف شرکت Ampliqon A/S
۱۶ – “کارگاه Advanced Real-Time PCR Data Analysis and Interpretation in Research, Clinics and Diagnosis” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۱۷ – “کارگاه Next Generation Sequencing Introduction, Application, Challenges and Methods of Data Analysis” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۱۸ – “کارگاه مبانی فلوسیتومتری و آنالیز داده¬ها” برگزار شده در پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فن آوری
۱۹ – “کارگاه Science data analysis by R software” برگزار شده در شبکه پزشکی و مولکولی کشور در انستیتو پاستور ایران
۲۰ – “کارگاه Plagiarism in Scientific Writing Workshop” برگزار شده در سومین کنگره بین المللی ایمونولوژی، آسم و آلرژی
۲۱ – “کارگاه Who is an author? (Steps to Authorship)” برگزار شده در سومین کنگره بین المللی ایمونولوژی، آسم و آلرژی
۲۲ – “کارگاه Patients and their Families Workshop: PID” برگزار شده در سومین کنگره بین المللی ایمونولوژی، آسم و آلرژی
۲۳ – “کارگاه تئوری و عملی یک روزه آموزش اطفاء حریق” برگزار شده در پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فن آوری
۲۴ – “کارگاه Health, Safety and Environment (HSE) in medical laboratory” برگزار شده در پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فن آوری

---

مهارت های نرم افزاری:
۱- مسلط بر نرم افزار office
۲- مسلط بر نرم افزار آماری SPSS
۳- مسلط بر نرم افزار آماری POPGENE V.1.31
۴- مسلط بر نرم افزار EndNote
۵- مسلط بر نرم افزار طراحی پرایمر Gene runner
۶- مسلط برنرم افزار طراحی پرایمر oligo
۷- مسلط بر نرم افزار progeny 7برای رسم شجره نامه و بررسی داده های مربوط به افراد مراجعه کننده و موارد مشاوره ژنتیک خانواده های دارای سابقه بیماری
۸- آشنایی با نرم افزار Allele ID
۹- مسلط بر نرم افزار¬های آنالیزی Linreg و Rest
۱۰- مسلط بر نرم افزار Geneious
۱۱- آشنایی با نرم افزار¬های طراحی siRNA از جمله siDESIGN, sidirect, jura siRNA selection server, sfold, Mfold
۱۲- آشنایی با نرم افزار آماری R
۱۳- مسلط برنرم افزار طراحی پرایمر primer3
۱۴- مسلط بر نرم افزار های آنالیز توالی یابی سنگر (Chromas، Peak scanner، seq scanner و …)
۱۵- مسلط به نرم افزارهای آنالیز داده¬های NGS (Fastqc، Trimmomatics، BWA، Hisat2، GATK، Samtools، Picard، VCF tools و …)

---

توانایی ها:
۱- طراحی پرایمر و پروب (primer design) با نرم افزارهای oligo, Gene runner and Geneious, primer3, Allele ID
۲- استخراج DNA از نمونه های خون (DNA preparation from blood samples)
۳- استخراج DNA از نمونه های بافتی فیکس شده در پارافین (DNA preparation from tissue samples)
۴- استخراج RNAاز نمونه های خون و بافت (RNA preparation from blood and tissue samples)
۵- سنتز cDNA
۶- تسلط بر تکنیک PCR- RFLP
۷- تسلط بر تکنیک PCR –SSCP
۸- تسلط بر تکنیک ARMS
۹- تسلط بر تکنیک PCR Allele specific
۱۰- استخراج از ژل برای توالی یابی(gel extraction)
۱۱- تسلط بر تکنیک agarose gel electrophoresis
۱۲- تسلط بر تکنیک acryl amide gel electrophoresis
۱۳- تسلط در سایت بیولوژی NCBi از جمله طراحی پرایمر در بخش Blast و جستجو در بخشهای مختلف این پایگاه داده
۱۴- تسلط بر تکنیک real time PCR و آشنایی با تکنیک HRM
۱۵- تسلط بر کشت سلول های تک هسته ای خون محیطی
۱۶- طراحی siRNA با چندین نرم افزار آنلاین و آفلاین
۱۷- مسلط به روش های ترانسفکت سلول های کشت شده
۱۸- مسلط به آنالیز داده های کروماتوگرام
۱۹- مسلط به آنالیز داده های فلوسیتومتری
۲۰- آشنایی با آنالیز داده های نسل بعدی توالی یابی
۲۱- مسلط به انجام تست MTT
۲۲- مسلط به بررسی آپوپتوز با روش رنگ آمیزی دوگانه اتیدیوم بروماید- اکریدین اورنج و تست فلوسیتومتری
۲۳- بررسی پروتئینی با روش الایزا و رنگ آمیزی درون سلولی و فلوسیتومتری
۲۴- مسلط به مراحل انجام توالی یابی سنگر
۲۵- مسلط به آنالیز داده های حاصل از توالی یابی سنگر
۲۶- مسلط به آنالیز داده های RNA-seq
۲۷- مسلط به آنالیز داده های DNA-seq